CentOS命令行安装Matlab R2017b
作者:matrix 发布时间:2019-07-26 分类:Linux
现在应要求需要再服务器端环境安装matlab以进行更好测试达到理想之效果。
测试环境:本地客户端macOS,服务器centOS 需要20GB空余
下载matlab
https://pan.baidu.com/s/1wijZCXIWsNXgz0yYYBXHnQ#提取e8b2
刚开始用mac三方百度客户端进行下载,没有校验文件md5和基本信息就直接对z01,z02进行解压拿到iso镜像文件挂载没问题。浪费时间一上午进行安装出现输入输出错误原因就是iso不完整。
文件哈希:
$ md5sum R2017b_glnxa64.iso
0bbe62e90ba9aaf357c72ef93e81753c R2017b_glnxa64.iso
若是本地上传到服务器最好使用rsync
附加参数-rP --append
来进行断点续传,要不然中断之后重新上传简直。。。
开始安装
需要系统有20GB
的剩余空间(包含iso文件,mnt挂载空间,程序安装空间)才可安装,我已经尝试过很多遍了😂😂😂
- 挂载镜像文件到
/mnt
$ mount -t iso9660 -o loop R2017b_glnxa64.iso文件路径 /mnt
如果挂载有问题可以考虑直接对iso进行解压缩:
$ sudo yum install p7zip p7zip-plugins $ 7z x ubuntu-16.10-server-amd64.iso
- 执行安装
若之前安装中断或者失败需要清空之前的安装数据,否则会报错。
删除之前安装的文件:rm -rf /usr/local/MATLAB
还有安装matlab之前java环境不是必须安装,matlab包里面会自带jre。$ cd /mnt $ sudo ./install -fileInstallationKey 09806-07443-53955-64350-21751-41297 -agreeToLicense yes -mode silent -activationPropertiesFile MATLABR2017b_Linux_Crack目录中的license_standalone.lic文件路径
说明:
license_standalone.lic文件路径需自行替换
09806-07443-53955-64350-21751-41297为install_key.txt
中的授权码执行之后就等待安装,若显示
要继续 请点击″是″。 要返回″否″。是否仍要继续?
这些也不用管。最终等待界面出现
End - Successful.Finished
即表示安装完成。
破解
安装完成之后执行程序/usr/local/MATLAB/R2017b/bin/matlab
显示未激活状态
错误: 激活无法继续。您可能需要执行以下任一操作:
1.设置 X11 显示,然后重新启动激活过程
2.使用静默激活功能
3.使用许可证中心激活
执行激活程序/usr/local/MATLAB/R2017b/bin/activate_matlab.sh -propertiesFile /usr/local/MATLAB/R2017b/activate.ini
也没有用。
最后拷贝破解文件解决:
进入破解文件license_standalone.lic,libmwservices.so 所在目录
sudo cp license_standalone.lic /usr/local/MATLAB/R2017b/licenses/
sudo cp libmwservices.so /usr/local/MATLAB/R2017b/bin/glnxa64/
启动matlab
设置环境变量,避免每次执行/usr/local/MATLAB/R2017b/bin/matlab
很麻烦
$ echo 'export PATH=/usr/local/MATLAB/R2017b/bin:$PATH' >> /etc/profile
$ source /etc/profile
以后输入matlab
就可以启动
卸载之前的iso:umount /mnt
若无法卸载参考https://www.cnblogs.com/sisimi/p/7700309.html来强制推出操作。
后台执行.m脚本
安装服务器版本的最终目的其实就是让其后台运行,但是后面测试的时候发现了很多坑。
比如手动执行nohup matlab -nojvm -nodesktop -nodisplay -nosplash -r test.m > ./logfile &
这样会导致日志输出结果出现大量错误warning的提示,我是直接用supervisord
来守护进程,避免手动执行nohup
操作。
如果你用nohup matlab -nodesktop -nosplash -nodisplay < test.m >logfile
这种<
形式来调用脚本那就要小心了,因为会出现更多的错误,像Undefined variable com or class com.mathworks.timer.TimerTask
都是小事情,然而我这里是提示语法逻辑错误,感觉是脚本文件加载的时候出现字符问题,原因有很多,我这里没有具体进一步测试。我建议还是不要用<
这种形式来执行.m脚本。
参考:https://blog.csdn.net/sethinking/article/details/88375995
还有一个就是执行matlab脚本目录的问题,如果像这样直接-r 'run("/root/test.m");'
执行入口脚本test.m很有可能会找不到其中依赖该目录下的自定义函数。建议-r 'cd /root;test;'
这种形式来调用。
最终这样调用:
$ matlab -nodesktop -nodisplay -nosplash -r 'cd /home/script/;main;' >> /root/matlab_log_`date +"%Y%m%d"`.log
说明:
/home/script/main.m为脚本入口
这里没有使用-nojvm参数,也没有进一步测试我的脚本依赖是否可以不启动。
>> /root/matlab_log_
date +"%Y%m%d".log
为输出日志,名称为日期年月日
报错整理
./install:行269: /bin/glnxa64/install_unix: 输入/输出错误
确保iso镜像文件的完整性,需要知道iso的文件如果缺失一部分也是可以挂载的。😂
建议在Windows端用winrar点击R2017b_glnxa64.zip
执行解压拿到R2017b_glnxa64.iso-
archive is not a ZIP archive
那就是空间不足的问题。 -
若非首次安装出现问题确保把之前的安装的文件都清空了
删除之前安装的文件:rm -rf /usr/local/MATLAB
-
出现libXt.so。。。Creating local MVM错误
MATLAB is selecting SOFTWARE OPENGL rendering. Unrecognized MATLAB option "version". Fatal Internal Error: Unexpected exception: 'N5boost16exception_detail10clone_implINS0_39current_exception_std_exception_wrapperISt13runtime_errorEEEE: Bundle#2 start failed: libXt.so.6: 无法打开共享对象文件: 没有那个文件或目录' in createMVMAndCallParser phase 'Creating local MVM'
这个问题今天上午才搞定,期间安装了很多包都不起作用。MD!!!
最终执行安装yum install libXt.x86_64
才解决。
中间我也查看过libXt.so.6这个鬼玩意的确是有的,后面看到因为matlab都需要32位和64位的包,所以这鬼玩意一直报错。
也有可能再期间安装的一部分包是依赖必须的:$ yum list installed |grep libX libX11.i686 1.6.5-2.el7 @base libX11.x86_64 1.6.5-2.el7 @base libX11-common.noarch 1.6.5-2.el7 @base libX11-devel.x86_64 1.6.5-2.el7 @base libXau.i686 1.0.8-2.1.el7 @base libXau.x86_64 1.0.8-2.1.el7 @base libXau-devel.x86_64 1.0.8-2.1.el7 @base libXdamage.x86_64 1.1.4-4.1.el7 @base libXdamage-devel.x86_64 1.1.4-4.1.el7 @base libXdmcp.i686 1.1.2-6.el7 @base libXext.i686 1.3.3-3.el7 @base libXext.x86_64 1.3.3-3.el7 @base libXext-devel.x86_64 1.3.3-3.el7 @base libXfixes.x86_64 5.0.3-1.el7 @base libXfixes-devel.x86_64 5.0.3-1.el7 @base libXft.x86_64 2.3.2-2.el7 @base libXft-devel.x86_64 2.3.2-2.el7 @base libXi.i686 1.7.9-1.el7 @base libXi.x86_64 1.7.9-1.el7 @base libXmu.i686 1.1.2-2.el7 @base libXp.i686 1.0.2-2.1.el7 @base libXp.x86_64 1.0.2-2.1.el7 @base libXrender.x86_64 0.9.10-1.el7 @base libXrender-devel.x86_64 0.9.10-1.el7 @base libXt.i686 1.1.5-3.el7 @base libXt.x86_64 1.1.5-3.el7 @base libXtst.i686 1.2.3-1.el7 @base libXtst.x86_64 1.2.3-1.el7 @base libXxf86vm.x86_64 1.1.4-1.el7 @base libXxf86vm-devel.x86_64 1.1.4-1.el7 @base
这里整理一份本机已安装所有
libX
开头的包,自行取舍。 -
大量报错信息 Bad file descriptor 和 Warning: "Error reading character from command line"
参照上面后台执行.m脚本
修改命令行调用的方式,去除nohup。使用supervisord
工具来守护进程,亦或者不要输出日志。
参考:
https://blog.csdn.net/qq_32892383/article/details/79670871
https://ww2.mathworks.cn/matlabcentral/answers/131366-why-do-i-see-i-o-errors-when-installing-matlab-using-the-iso-image
https://ww2.mathworks.cn/matlabcentral/answers/98745-why-do-i-receive-an-error-message-archive-is-not-a-zip-archive-during-matlab-installation-on-Linux
https://www.jianshu.com/p/a10397fcfb1d
https://blog.csdn.net/Xiao_Song_PKU/article/details/82700228
https://www.cnblogs.com/yaoyaoliu/p/6798463.html
https://Linux.cn/article-7992-1.html
https://blog.csdn.net/qq_39187538/article/details/88676283
https://www.cnblogs.com/sisimi/p/7700309.html
https://www.centos.org/forums/viewtopic.php?t=31436
https://ww2.mathworks.cn/matlabcentral/answers/63751-how-do-i-get-matlab-running-in-batch-mode-to-only-output-the-results-of-disp-fprintf-etc-and-no
https://ww2.mathworks.cn/matlabcentral/answers/66793-problem-running-matlab-script-to-background
matlab调用python库函数和自定义脚本函数
作者:matrix 发布时间:2019-07-15 分类:零零星星
本来只是想获取字符串的MD5hash值,结果发现麻烦。首先去mathworks找到的DataHash,GetMD5这些函数要么无法使用,要么就是计算出来的md5值是错误的,反正达不到效果。
刚开始以为mathworks的代码必须登录账户才能下载,现在才发现,点击Overview旁边的Functions
选项卡就能看到源代码。 😂
当初就算是找到了一些函数也是不能使用,最后还是使用python库来解决。好在matlab对python的调用非常简单。直接使用py
库就好了,唯一的问题就是有些python的语法和matlab不同,比如切片[:::]
操作这些。
安装python3环境
2019-08-19测试发现macos中3.7版本可以,但是在centOS中就调用失败。所以就centOS中测试安装3.5的版本了。
后面发现应该是编译时的enable-shared参数问题。
2020-02-18centos中测试可以直接用conda来安装python3.5使用,3.6,3.7测试调用失败!
开始手动编译安装
cd ~
yum install zlib-devel bzip2-devel openssl-devel ncurese-devel
wget https://www.python.org/ftp/python/3.5.0/Python-3.5.0.tgz
tar xf Python-3.5.0.tgz
cd Python-3.5.0
./configure --enable-shared #matlab要求必须设置enable-shared参数
make && make install
参考:
https://ww2.mathworks.cn/help/matlab/matlab_external/undefined-variable-py-or-function-py-command.html#buialof-67
https://ww2.mathworks.cn/help/matlab/getting-started-with-python.html?lang=en
切换默认的python解释器
matlab输入
pyversion`可以查看python解释器路径,如果需要修改:
pyversion /usr/local/bin/python3 %切换到python3.7指定路径
直接调用python内置函数
计算字符串md5函数
使用python的hashlib库进行操作
function[re]=md5(str)
%{
依赖python进行md5 hash
%}
m2 = py.hashlib.md5();
m2.update(py.str(str).encode('utf-8'));
re = char(m2.hexdigest());
说明:
此函数依赖python环境,确保系统中有安装。
兼容Linux,Mac,Windows
最后char函数是将py.str
类型转换为matlab的str
知道了这个操作,以后很多操作就会非常简单。
比如
获取当前时间戳:
str2num(char(py.int(py.time.time())))
直接用py
库来调用即可,最后再使用matlab函数str2num,char处理成number类型。
调用自定义.py脚本函数
上面的方法倒是可以解决一部分难题,但是遇到方括号[]、百分号%操作符这些直接在.m
文件中就不会执行了。毕竟matlab是以它的语法来解析,这样只得起调.py
文件来操作。
新建test.py
文件位于当前工作目录
def func():
return '123'[::-1]
载入python脚本:
%脚本所在路径,空字符串表示当前目录
path = '' %当前目录
%path = 'a/' %当前的子目录a
if count(py.sys.path,path) == 0
insert(py.sys.path,int32(0),path);
end
%清除脚本缓存,执行重载操作
clear classes;
mod = py.importlib.import_module('test');%载入的脚本模块
%mod = py.importlib.import_module('a.test');%载入的子目录下的脚本模块
py.importlib.reload(mod);
调用py.test.func
即可得到切片结果321
,注意为py.str
类型。
子目录形同:py.子目录.文件名.函数名
当修改py文件之后再调用会发现还是之前的结果,matlab缓存了之前的python脚本,所以这里需要clear classes...
这类操作。
参考:
MATLAB 调用 Python
https://www.cnblogs.com/zknublx/p/6212590.html
https://blog.csdn.net/jnulzl/article/details/51170859
https://zhuanlan.zhihu.com/p/42598340
https://blog.csdn.net/x5675602/article/details/52134981
http://www.1cae.com/a/MatLab/52/python-matlab-8943.htm